Диаграмма на которой видна структура и порядок подчинения стандартных модулей magento.

Если правильно понимаю если выключить вышестоящий модуль, автоматом выключаются все модули под ним.

Если выключить mage_core получаем белый экран Magento (=

В админке Magento можно управлять модулями со странички Система > Конфигурация  > Расширенные > Расширенные

Если по ошибке выключили модуль mage_core, и у вас появился белый экран там где должен был быть фронтенд и бекенд! (=
Делаем следующее:
1. идем в базу SQL
2. выбираем таблицу core_config_data
3. далее находим path
4. в нем advanced/modules_disable_output/Mage_Core
5. меняем значение 1 на 0