Диаграмма на которой видна структура и порядок подчинения стандартных модулей magento.

Если правильно понимаю если выключить вышестоящий модуль, автоматом выключаются все модули под ним.

Если выключить mage_core получаем белый экран Magento (=

В админке Magento можно управлять модулями со странички Система > Конфигурация  > Расширенные > Расширенные